编者按:在第18届世界肺癌大会的“MA20:肺科/内窥镜检查最新进展”专场,医院呼吸科暨上海市呼吸病研究所童琳博士报告了一项研究(MA20.13:etDNA:Tumor-DerivedDNAfromPleuralEffusionSupernatantasaPromisingSourceforNGSBasedMutationProfilinginLungCancer),凭借这项研究摘要,她获得了WCLC的TravelAward。以下为研究主要内容。
etDNA:肺癌患者胸水上清中的肿瘤来源DNA有望用于基于二代测序(NGS)的基因突变检测
背景:循环肿瘤DNA(circulatingtumorDNA,ctDNA)和胸水沉渣中的肿瘤细胞(tumorcellsinpleuraleffusion,ETCs)已被广泛应用在临床检测中。多项研究表明,胸水上清液中提取的肿瘤来源DNA(tumor-derivedDNAfrompleuraleffusionsupernatant,etDNA)可作为肺癌患者检测基因突变更好的选择。但是,对于不同类型的液体活检所获肿瘤DNA的丰度和差异知之甚少。
方法:我们针对63例肺癌患者(58例腺癌,2例腺鳞癌,2例小细胞肺癌和1例神经内分泌癌)的肿瘤组织、胸水(etDNA和ETCs)和同期的血浆ctDNA,通过靶向二代测序(NGS)进行基因谱检测,其中30例患者具有匹配的肿瘤组织标本。每例患者的全血基因组DNA作为种系基因对照。驱动突变和重排特征通过在肿瘤组织中进行ARMS-PCR、FISH或VentanaIHC作为金标准进行验证。结果:我们发现在分别检测的etDNA、ETCDNA和ctDNA标本中,etDNA的肿瘤特有突变检出率比ETCDNA和ctDNA都高。etDNA中所检出突变的丰度比ETCDNA和ctDNA均高,而与组织相近。etDNA的基因变异类型和分布与组织接近。拷贝数变异(copynumbervariations,CNVs)在血浆ctDNA中检出率最低,可能与正常细胞DNA稀释有关。以肿瘤组织为金标准,肺癌驱动基因的检测敏感性etDNA比ETCDNA和ctDNA都要高。此外,etDNA中检测到的驱动基因突变和重排与靶向治疗的有效性密切相关。进一步分层分析发现,仅有胸腔内转移(M1a期)的患者中,etDNA的肿瘤特有突变检出率最高。而在合并胸腔外转移(M1b和M1c期)的患者中,etDNA与ETCDNA、血浆的肿瘤特有突变检出率没有显著性差异。
结论:这项研究表明,与ETCs和ctDNA相比,etDNA具有更高的肿瘤特有突变检出率和敏感性。从胸水上清液中获取的etDNA可以作为基因突变检测的优质标本来源,用于指导肺癌患者的治疗决策。
在《肿瘤瞭望》的采访中,童琳博士分享了获奖经历和参会感受:这次很荣幸获得第18届世界肺癌大会的TravelAward,非常感谢指导老师胡洁教授,是她指导我在肿瘤研究中一步一步走向深入,感谢导师宋元林教授给予我的支持,感谢我的硕士导师白春学教授对我的谆谆教导。接下来,我们将在目前的研究基础上进一步深入,希望能发现新的肿瘤发生发展的机制,寻找新的靶标,把肺癌治疗向前推进。根据我的参会经历,WCLC会议最热门的领域是免疫治疗,大会设置了多个免疫治疗的专场,介绍免疫治疗相关的方方面面的内容,对免疫联合疗法、免疫治疗的生物标志物、适用人群、免疫治疗的*性管理等进行深入研讨,让参会者可以更好地了解“免疫治疗的来世今生”。
(来源:《肿瘤瞭望》编辑部)
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